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上海生科院Philipp Khaitovich研究組**繪制哺乳動物大腦snRNA和snoRNA表達圖譜

    近日,國際學術期刊《Genome Biology and evolution》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所Philipp Khaitovich研究組的研究論文“Changes in snoRNA and snRNA abundance in the human, chimpanzee, macaque and mouse brain”。該研究**繪制了哺乳動物大腦snRNA和snoRNA表達圖譜,發現哺乳動物大腦snRNA和snoRNA表達水平存在廣泛差異。
    snRNA和snoRNA是功能和進化保守的轉錄調控元件,但長期以來缺乏其在人腦轉錄組水平的系統研究。Philipp Khaitovich研究組與俄羅斯莫斯科大學Mikhail S. Gelfand教授合作,利用高通量測序技術系統地測定了人、黑猩猩、恒河猴和小鼠大腦前額葉皮質組織中snRNA和snoRNA的表達量,通過比較分析發現snRNA和snoRNA在基因家族水平上非常保守,但是其中U1和SNORA29表達量在人腦中卻發生了巨大變化。SNORA29 在人腦中表現為特異表達缺失,并且實驗發現SNORA29在非人靈長類的神經元中特異表達,提示其在人腦認知功能形成中的潛在作用。同時,該研究發現與mRNA的表達主要受啟動子調控不同,二級結構穩定性是snoRNA表達調控的重要機制。
    本研究是對snRNA和snoRNA在人腦進化中作用的多物種系統性研究,對于探尋人腦認知功能的分子調控機制具有重要意義。

    Genome Biol Evol:上海生科院Philipp Khaitovich研究組**繪制哺乳動物大腦snRNA和snoRNA表達圖譜
    snoRNA表達量調控機制示意圖: mRNA表達量主要由啟動子和增強子的轉錄活性高(淺藍)低(深藍)決定。snoRNA表達量不依賴宿主基因,而主要由自身結構穩定性高(紅)低(藍)決定。

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